Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC1P62191 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSMC1P62191 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSMC1P62191 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms