Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCS1P62166 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCS1P62166 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCS1P62166 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCS1P62166 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCS1P62166 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCS1P62166 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCS1P62166 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NCS1P62166 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCS1P62166 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCS1P62166 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCS1P62166 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCS1P62166 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCS1P62166 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCS1P62166 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCS1P62166 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCS1P62166 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NCS1P62166 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NCS1P62166 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCS1P62166 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCS1P62166 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCS1P62166 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCS1P62166 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCS1P62166 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCS1P62166 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCS1P62166 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCS1P62166 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCS1P62166 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NCS1P62166 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCS1P62166 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NCS1P62166 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCS1P62166 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCS1P62166 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCS1P62166 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCS1P62166 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCS1P62166 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCS1P62166 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCS1P62166 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCS1P62166 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCS1P62166 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCS1P62166 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCS1P62166 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCS1P62166 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCS1P62166 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCS1P62166 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCS1P62166 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCS1P62166 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCS1P62166 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCS1P62166 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCS1P62166 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCS1P62166 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCS1P62166 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCS1P62166 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCS1P62166 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCS1P62166 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCS1P62166 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCS1P62166 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NCS1P62166 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCS1P62166 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCS1P62166 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCS1P62166 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCS1P62166 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCS1P62166 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCS1P62166 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCS1P62166 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCS1P62166 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCS1P62166 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCS1P62166 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCS1P62166 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCS1P62166 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCS1P62166 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NCS1P62166 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCS1P62166 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCS1P62166 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCS1P62166 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCS1P62166 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms