Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COPZ1P61923 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COPZ1P61923 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms