Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC18A1P54219 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC18A1P54219 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC18A1P54219 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC18A1P54219 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms