Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 47.3
SUB1P53999 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 47.3
SUB1P53999 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 47.3
SUB1P53999 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 47.3
SUB1P53999 PARVB-206ENST00000477438 421 ntTSL 58.58□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 47.3
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SUB1P53999 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.685e-9■■■■■ 47.3
SUB1P53999 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.785e-9■■■■■ 47.3
SUB1P53999 ARPC5-204ENST00000462965 2455 ntTSL 23.25□□□□□ -1.895e-9■■■■■ 47.3
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SUB1P53999 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.835e-11■■■■■ 47.2
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SUB1P53999 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.54e-10■■■■■ 47.2
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SUB1P53999 UCK2-202ENST00000462329 830 ntTSL 1 (best)4.38□□□□□ -1.714e-10■■■■■ 47.2
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SUB1P53999 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.484e-10■■■■■ 47.2
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SUB1P53999 NONO-214ENST00000490044 3215 ntTSL 25.98□□□□□ -1.452e-12■■■■■ 47.1
SUB1P53999 PSMD10-201ENST00000217958 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 47.1
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SUB1P53999 PKM-202ENST00000335181 2318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.831e-15■■■■■ 47.1
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SUB1P53999 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-14■■■■■ 46.9
SUB1P53999 TOMM22-202ENST00000492561 782 ntTSL 214.14□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 46.8
SUB1P53999 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 46.8
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SUB1P53999 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-9■■■■■ 46.8
SUB1P53999 TRAPPC6A-203ENST00000587818 433 ntTSL 214.95□□□□□ -0.022e-16■■■■■ 46.7
SUB1P53999 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.169e-12■■■■■ 46.6
SUB1P53999 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.629e-12■■■■■ 46.6
SUB1P53999 HIBADH-203ENST00000428288 1669 ntTSL 316.37■□□□□ 0.212e-14■■■■■ 46.5
SUB1P53999 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-14■■■■■ 46.5
SUB1P53999 ALDOA-217ENST00000566130 801 ntTSL 210.5□□□□□ -0.736e-27■■■■■ 46.4
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SUB1P53999 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 46.4
SUB1P53999 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 46.4
SUB1P53999 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 46.4
SUB1P53999 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.632e-7■■■■■ 46.4
SUB1P53999 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 46.4
SUB1P53999 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 44.44□□□□□ -1.72e-7■■■■■ 46.4
SUB1P53999 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 43.85□□□□□ -1.792e-7■■■■■ 46.4
SUB1P53999 CCT4-203ENST00000461540 638 ntTSL 32.63□□□□□ -1.993e-9■■■■■ 46.3
SUB1P53999 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 46.2
SUB1P53999 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 46.2
SUB1P53999 MRPL33-204ENST00000472192 238 ntTSL 37.52□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 46.2
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