Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYBA4P53673 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRYBA4P53673 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRYBA4P53673 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms