Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VEGFBP49765 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VEGFBP49765 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
VEGFBP49765 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VEGFBP49765 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms