Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPAP49450 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPAP49450 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPAP49450 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPAP49450 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPAP49450 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPAP49450 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CENPAP49450 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPAP49450 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPAP49450 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPAP49450 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPAP49450 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPAP49450 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPAP49450 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CENPAP49450 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPAP49450 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPAP49450 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPAP49450 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPAP49450 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPAP49450 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPAP49450 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CENPAP49450 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPAP49450 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPAP49450 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPAP49450 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPAP49450 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPAP49450 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPAP49450 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPAP49450 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CENPAP49450 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPAP49450 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPAP49450 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPAP49450 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPAP49450 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPAP49450 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPAP49450 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CENPAP49450 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPAP49450 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPAP49450 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPAP49450 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPAP49450 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPAP49450 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPAP49450 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPAP49450 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPAP49450 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CENPAP49450 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CENPAP49450 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPAP49450 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPAP49450 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPAP49450 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPAP49450 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPAP49450 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPAP49450 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CENPAP49450 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPAP49450 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPAP49450 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPAP49450 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPAP49450 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPAP49450 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CENPAP49450 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPAP49450 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPAP49450 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPAP49450 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPAP49450 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPAP49450 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CENPAP49450 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPAP49450 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPAP49450 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPAP49450 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPAP49450 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPAP49450 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPAP49450 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPAP49450 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPAP49450 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPAP49450 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPAP49450 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPAP49450 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPAP49450 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPAP49450 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPAP49450 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPAP49450 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPAP49450 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPAP49450 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPAP49450 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPAP49450 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPAP49450 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPAP49450 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPAP49450 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPAP49450 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPAP49450 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPAP49450 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPAP49450 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPAP49450 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPAP49450 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPAP49450 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPAP49450 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPAP49450 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPAP49450 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPAP49450 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPAP49450 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms