Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX9P48436 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX9P48436 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX9P48436 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX9P48436 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX9P48436 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX9P48436 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX9P48436 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX9P48436 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX9P48436 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX9P48436 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX9P48436 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX9P48436 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX9P48436 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX9P48436 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX9P48436 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX9P48436 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX9P48436 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX9P48436 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX9P48436 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX9P48436 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX9P48436 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX9P48436 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX9P48436 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX9P48436 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX9P48436 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX9P48436 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX9P48436 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX9P48436 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX9P48436 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX9P48436 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX9P48436 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX9P48436 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX9P48436 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX9P48436 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX9P48436 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX9P48436 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX9P48436 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX9P48436 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX9P48436 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX9P48436 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX9P48436 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX9P48436 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX9P48436 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX9P48436 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX9P48436 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX9P48436 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX9P48436 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX9P48436 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX9P48436 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX9P48436 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX9P48436 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX9P48436 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX9P48436 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX9P48436 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX9P48436 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX9P48436 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX9P48436 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX9P48436 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX9P48436 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX9P48436 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX9P48436 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX9P48436 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX9P48436 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX9P48436 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX9P48436 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX9P48436 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX9P48436 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX9P48436 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX9P48436 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX9P48436 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX9P48436 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX9P48436 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX9P48436 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX9P48436 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX9P48436 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX9P48436 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX9P48436 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX9P48436 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX9P48436 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX9P48436 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX9P48436 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX9P48436 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX9P48436 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX9P48436 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX9P48436 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX9P48436 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX9P48436 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX9P48436 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms