Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSOP43234 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSOP43234 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSOP43234 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSOP43234 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTSOP43234 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTSOP43234 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSOP43234 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSOP43234 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSOP43234 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSOP43234 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTSOP43234 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSOP43234 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSOP43234 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSOP43234 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSOP43234 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSOP43234 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSOP43234 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTSOP43234 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSOP43234 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSOP43234 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSOP43234 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSOP43234 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSOP43234 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTSOP43234 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSOP43234 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSOP43234 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSOP43234 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSOP43234 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSOP43234 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSOP43234 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTSOP43234 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSOP43234 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSOP43234 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTSOP43234 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSOP43234 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSOP43234 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSOP43234 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSOP43234 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSOP43234 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSOP43234 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTSOP43234 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSOP43234 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSOP43234 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTSOP43234 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTSOP43234 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTSOP43234 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSOP43234 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSOP43234 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSOP43234 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTSOP43234 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSOP43234 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSOP43234 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSOP43234 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSOP43234 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTSOP43234 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSOP43234 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSOP43234 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSOP43234 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSOP43234 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTSOP43234 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSOP43234 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSOP43234 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSOP43234 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSOP43234 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTSOP43234 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSOP43234 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSOP43234 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSOP43234 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSOP43234 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSOP43234 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSOP43234 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTSOP43234 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTSOP43234 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSOP43234 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTSOP43234 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSOP43234 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSOP43234 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSOP43234 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSOP43234 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSOP43234 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSOP43234 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTSOP43234 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSOP43234 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSOP43234 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSOP43234 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSOP43234 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSOP43234 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSOP43234 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTSOP43234 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms