Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN7P41732 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN7P41732 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN7P41732 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms