Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNFP41002 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNFP41002 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNFP41002 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNFP41002 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNFP41002 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNFP41002 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNFP41002 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNFP41002 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNFP41002 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNFP41002 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNFP41002 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNFP41002 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNFP41002 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNFP41002 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNFP41002 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNFP41002 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNFP41002 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNFP41002 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNFP41002 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNFP41002 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNFP41002 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNFP41002 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNFP41002 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNFP41002 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNFP41002 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNFP41002 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNFP41002 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNFP41002 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNFP41002 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNFP41002 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNFP41002 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNFP41002 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNFP41002 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNFP41002 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNFP41002 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNFP41002 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNFP41002 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNFP41002 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNFP41002 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNFP41002 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNFP41002 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNFP41002 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNFP41002 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNFP41002 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNFP41002 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNFP41002 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNFP41002 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNFP41002 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNFP41002 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNFP41002 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNFP41002 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNFP41002 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNFP41002 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNFP41002 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNFP41002 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNFP41002 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNFP41002 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNFP41002 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNFP41002 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNFP41002 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNFP41002 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNFP41002 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNFP41002 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNFP41002 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNFP41002 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNFP41002 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNFP41002 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNFP41002 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNFP41002 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNFP41002 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNFP41002 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNFP41002 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNFP41002 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNFP41002 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNFP41002 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNFP41002 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNFP41002 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNFP41002 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNFP41002 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNFP41002 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNFP41002 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNFP41002 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNFP41002 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNFP41002 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNFP41002 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNFP41002 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms