Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4A3P38919 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4A3P38919 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4A3P38919 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms