Protein–RNA interactions for Protein: P34931

HSPA1L, Heat shock 70 kDa protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA1LP34931 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HSPA1LP34931 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HSPA1LP34931 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HSPA1LP34931 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HSPA1LP34931 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
HSPA1LP34931 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
HSPA1LP34931 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
HSPA1LP34931 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
HSPA1LP34931 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
HSPA1LP34931 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSPA1LP34931 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HSPA1LP34931 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.82■■■■□ 3
HSPA1LP34931 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
HSPA1LP34931 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.81■■■■□ 3
HSPA1LP34931 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HSPA1LP34931 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.8■■■■□ 3
HSPA1LP34931 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HSPA1LP34931 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HSPA1LP34931 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HSPA1LP34931 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HSPA1LP34931 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
HSPA1LP34931 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
HSPA1LP34931 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HSPA1LP34931 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HSPA1LP34931 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HSPA1LP34931 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
HSPA1LP34931 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HSPA1LP34931 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
HSPA1LP34931 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HSPA1LP34931 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
HSPA1LP34931 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
HSPA1LP34931 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HSPA1LP34931 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.78■■■■□ 3
HSPA1LP34931 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HSPA1LP34931 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HSPA1LP34931 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
HSPA1LP34931 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms