Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA13P31271 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA13P31271 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA13P31271 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA13P31271 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms