Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF2E1P29083 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF2E1P29083 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GTF2E1P29083 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms