Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HTR2AP28223 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTR2AP28223 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTR2AP28223 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms