Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APEX1P27695 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX1P27695 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX1P27695 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX1P27695 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX1P27695 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX1P27695 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX1P27695 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX1P27695 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX1P27695 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX1P27695 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APEX1P27695 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX1P27695 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX1P27695 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX1P27695 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX1P27695 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX1P27695 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX1P27695 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX1P27695 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APEX1P27695 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APEX1P27695 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APEX1P27695 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APEX1P27695 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX1P27695 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX1P27695 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX1P27695 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APEX1P27695 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX1P27695 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX1P27695 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX1P27695 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX1P27695 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX1P27695 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX1P27695 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APEX1P27695 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX1P27695 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX1P27695 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX1P27695 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX1P27695 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX1P27695 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APEX1P27695 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX1P27695 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX1P27695 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX1P27695 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX1P27695 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX1P27695 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX1P27695 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX1P27695 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX1P27695 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APEX1P27695 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX1P27695 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX1P27695 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APEX1P27695 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX1P27695 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX1P27695 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX1P27695 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APEX1P27695 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APEX1P27695 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APEX1P27695 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APEX1P27695 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APEX1P27695 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APEX1P27695 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX1P27695 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APEX1P27695 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX1P27695 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX1P27695 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX1P27695 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX1P27695 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX1P27695 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX1P27695 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX1P27695 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APEX1P27695 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX1P27695 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX1P27695 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APEX1P27695 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms