Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNCP24863 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNCP24863 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNCP24863 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNCP24863 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNCP24863 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNCP24863 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNCP24863 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNCP24863 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNCP24863 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNCP24863 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNCP24863 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNCP24863 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNCP24863 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNCP24863 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNCP24863 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNCP24863 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNCP24863 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNCP24863 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNCP24863 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNCP24863 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNCP24863 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNCP24863 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNCP24863 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNCP24863 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNCP24863 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNCP24863 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNCP24863 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNCP24863 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNCP24863 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNCP24863 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNCP24863 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNCP24863 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNCP24863 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNCP24863 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNCP24863 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNCP24863 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNCP24863 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNCP24863 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNCP24863 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNCP24863 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNCP24863 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNCP24863 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNCP24863 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNCP24863 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNCP24863 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNCP24863 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNCP24863 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNCP24863 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNCP24863 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNCP24863 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNCP24863 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNCP24863 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNCP24863 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNCP24863 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNCP24863 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNCP24863 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNCP24863 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNCP24863 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNCP24863 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNCP24863 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNCP24863 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNCP24863 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNCP24863 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNCP24863 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNCP24863 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNCP24863 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNCP24863 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNCP24863 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNCP24863 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNCP24863 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNCP24863 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNCP24863 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNCP24863 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNCP24863 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNCP24863 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNCP24863 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNCP24863 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNCP24863 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNCP24863 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNCP24863 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNCP24863 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNCP24863 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNCP24863 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNCP24863 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNCP24863 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNCP24863 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNCP24863 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNCP24863 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNCP24863 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNCP24863 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNCP24863 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNCP24863 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNCP24863 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNCP24863 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNCP24863 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNCP24863 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNCP24863 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNCP24863 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNCP24863 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms