Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI1P19237 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNI1P19237 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNI1P19237 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNI1P19237 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms