Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMIM10L1P0DMW3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMIM10L1P0DMW3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM10L1P0DMW3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms