Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATXN8OSP0DMR3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATXN8OSP0DMR3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms