Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2P0DI81 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2P0DI81 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2P0DI81 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms