Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PNMA6AP0CW24 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PNMA6AP0CW24 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PNMA6AP0CW24 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms