Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK1P06493 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK1P06493 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK1P06493 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK1P06493 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK1P06493 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK1P06493 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK1P06493 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK1P06493 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK1P06493 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK1P06493 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK1P06493 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK1P06493 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK1P06493 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK1P06493 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK1P06493 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK1P06493 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK1P06493 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK1P06493 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK1P06493 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK1P06493 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK1P06493 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK1P06493 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK1P06493 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK1P06493 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK1P06493 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK1P06493 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK1P06493 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK1P06493 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK1P06493 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK1P06493 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK1P06493 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK1P06493 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK1P06493 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK1P06493 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK1P06493 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDK1P06493 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK1P06493 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK1P06493 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK1P06493 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK1P06493 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK1P06493 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDK1P06493 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK1P06493 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK1P06493 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK1P06493 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK1P06493 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDK1P06493 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK1P06493 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK1P06493 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK1P06493 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK1P06493 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK1P06493 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK1P06493 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK1P06493 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK1P06493 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK1P06493 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK1P06493 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK1P06493 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK1P06493 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK1P06493 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK1P06493 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK1P06493 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK1P06493 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK1P06493 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK1P06493 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK1P06493 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK1P06493 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK1P06493 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK1P06493 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK1P06493 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK1P06493 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK1P06493 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK1P06493 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK1P06493 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK1P06493 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK1P06493 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK1P06493 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK1P06493 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms