Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNOT4O95628 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT4O95628 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT4O95628 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT4O95628 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT4O95628 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT4O95628 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT4O95628 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNOT4O95628 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT4O95628 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT4O95628 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT4O95628 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT4O95628 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNOT4O95628 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT4O95628 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT4O95628 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT4O95628 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNOT4O95628 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNOT4O95628 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNOT4O95628 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT4O95628 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT4O95628 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT4O95628 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT4O95628 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT4O95628 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT4O95628 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT4O95628 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNOT4O95628 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT4O95628 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT4O95628 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT4O95628 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNOT4O95628 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNOT4O95628 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNOT4O95628 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms