Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIOO75962 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIOO75962 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIOO75962 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIOO75962 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIOO75962 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIOO75962 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIOO75962 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIOO75962 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIOO75962 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIOO75962 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIOO75962 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIOO75962 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIOO75962 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIOO75962 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIOO75962 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIOO75962 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIOO75962 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIOO75962 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIOO75962 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIOO75962 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIOO75962 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIOO75962 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIOO75962 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIOO75962 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIOO75962 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIOO75962 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIOO75962 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIOO75962 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIOO75962 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIOO75962 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIOO75962 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIOO75962 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIOO75962 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIOO75962 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIOO75962 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIOO75962 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIOO75962 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIOO75962 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIOO75962 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIOO75962 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIOO75962 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIOO75962 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIOO75962 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIOO75962 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIOO75962 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIOO75962 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIOO75962 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIOO75962 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIOO75962 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIOO75962 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIOO75962 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIOO75962 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIOO75962 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIOO75962 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIOO75962 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIOO75962 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIOO75962 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIOO75962 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIOO75962 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIOO75962 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIOO75962 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIOO75962 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIOO75962 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIOO75962 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIOO75962 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOO75962 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOO75962 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOO75962 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOO75962 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOO75962 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOO75962 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIOO75962 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOO75962 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOO75962 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOO75962 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOO75962 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOO75962 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOO75962 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOO75962 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIOO75962 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOO75962 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOO75962 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOO75962 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOO75962 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOO75962 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIOO75962 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.01■■□□□ 1.6
TRIOO75962 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOO75962 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOO75962 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOO75962 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOO75962 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOO75962 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIOO75962 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOO75962 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOO75962 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOO75962 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOO75962 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOO75962 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIOO75962 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms