Protein–RNA interactions for Protein: O75691

UTP20, Small subunit processome component 20 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP20O75691 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP20O75691 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP20O75691 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP20O75691 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UTP20O75691 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UTP20O75691 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP20O75691 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP20O75691 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP20O75691 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP20O75691 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP20O75691 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP20O75691 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UTP20O75691 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP20O75691 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP20O75691 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP20O75691 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UTP20O75691 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UTP20O75691 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UTP20O75691 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP20O75691 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP20O75691 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP20O75691 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UTP20O75691 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP20O75691 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP20O75691 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP20O75691 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP20O75691 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP20O75691 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP20O75691 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP20O75691 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTP20O75691 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP20O75691 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP20O75691 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP20O75691 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP20O75691 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTP20O75691 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP20O75691 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP20O75691 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP20O75691 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP20O75691 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP20O75691 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP20O75691 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP20O75691 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTP20O75691 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTP20O75691 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP20O75691 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP20O75691 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP20O75691 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP20O75691 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UTP20O75691 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UTP20O75691 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UTP20O75691 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTP20O75691 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTP20O75691 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTP20O75691 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UTP20O75691 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UTP20O75691 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UTP20O75691 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP20O75691 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP20O75691 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP20O75691 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP20O75691 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UTP20O75691 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP20O75691 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UTP20O75691 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP20O75691 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UTP20O75691 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP20O75691 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UTP20O75691 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP20O75691 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP20O75691 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UTP20O75691 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UTP20O75691 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UTP20O75691 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UTP20O75691 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UTP20O75691 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP20O75691 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UTP20O75691 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP20O75691 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UTP20O75691 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP20O75691 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UTP20O75691 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP20O75691 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UTP20O75691 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP20O75691 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP20O75691 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP20O75691 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP20O75691 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UTP20O75691 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms