Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMIM24O75264 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM24O75264 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMIM24O75264 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms