Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KERAO60938 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KERAO60938 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KERAO60938 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KERAO60938 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KERAO60938 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KERAO60938 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KERAO60938 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KERAO60938 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KERAO60938 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KERAO60938 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KERAO60938 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KERAO60938 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KERAO60938 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KERAO60938 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KERAO60938 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KERAO60938 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KERAO60938 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KERAO60938 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KERAO60938 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KERAO60938 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KERAO60938 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KERAO60938 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KERAO60938 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KERAO60938 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KERAO60938 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KERAO60938 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KERAO60938 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KERAO60938 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KERAO60938 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KERAO60938 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms