Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC22O60826 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC22O60826 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC22O60826 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms