Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSCO60682 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSCO60682 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSCO60682 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSCO60682 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSCO60682 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSCO60682 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSCO60682 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSCO60682 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSCO60682 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MSCO60682 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MSCO60682 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSCO60682 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MSCO60682 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MSCO60682 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MSCO60682 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSCO60682 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSCO60682 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSCO60682 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSCO60682 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MSCO60682 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MSCO60682 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MSCO60682 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MSCO60682 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MSCO60682 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSCO60682 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MSCO60682 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MSCO60682 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MSCO60682 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSCO60682 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MSCO60682 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSCO60682 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MSCO60682 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSCO60682 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSCO60682 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSCO60682 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSCO60682 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MSCO60682 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSCO60682 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSCO60682 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSCO60682 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSCO60682 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSCO60682 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSCO60682 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSCO60682 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MSCO60682 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSCO60682 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSCO60682 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSCO60682 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MSCO60682 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSCO60682 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSCO60682 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSCO60682 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSCO60682 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSCO60682 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSCO60682 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSCO60682 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSCO60682 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MSCO60682 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSCO60682 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSCO60682 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSCO60682 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSCO60682 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSCO60682 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSCO60682 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSCO60682 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSCO60682 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSCO60682 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MSCO60682 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MSCO60682 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MSCO60682 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSCO60682 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSCO60682 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSCO60682 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSCO60682 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSCO60682 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSCO60682 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSCO60682 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSCO60682 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSCO60682 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSCO60682 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSCO60682 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSCO60682 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MSCO60682 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSCO60682 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSCO60682 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSCO60682 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSCO60682 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MSCO60682 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MSCO60682 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms