Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MARCH6O60337 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MARCH6O60337 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH6O60337 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH6O60337 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH6O60337 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH6O60337 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH6O60337 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms