Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8B1O43520 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8B1O43520 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8B1O43520 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8B1O43520 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms