Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LINC01565O15544 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LINC01565O15544 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LINC01565O15544 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LINC01565O15544 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms