Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
N4BP3O15049 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
N4BP3O15049 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
N4BP3O15049 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms