Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IKBKBO14920 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IKBKBO14920 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
IKBKBO14920 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms