Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
J3KR12 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3KR12 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3KR12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3KR12 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3KR12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
J3KR12 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
J3KR12 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
J3KR12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
J3KR12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KR12 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KR12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KR12 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KR12 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KR12 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KR12 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KR12 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KR12 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
J3KR12 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
J3KR12 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
J3KR12 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
J3KR12 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
J3KR12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
J3KR12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
J3KR12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
J3KR12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
J3KR12 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
J3KR12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
J3KR12 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
J3KR12 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
J3KR12 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
J3KR12 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
J3KR12 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KR12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KR12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KR12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KR12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KR12 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KR12 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KR12 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KR12 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KR12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
J3KR12 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KR12 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KR12 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KR12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KR12 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KR12 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KR12 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KR12 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KR12 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KR12 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
J3KR12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
J3KR12 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
J3KR12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
J3KR12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
J3KR12 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
J3KR12 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
J3KR12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
J3KR12 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
J3KR12 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
J3KR12 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
J3KR12 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
J3KR12 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
J3KR12 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
J3KR12 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
J3KR12 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
J3KR12 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
J3KR12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
J3KR12 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
J3KR12 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
J3KR12 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
J3KR12 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
J3KR12 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
J3KR12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
J3KR12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
J3KR12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
J3KR12 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
J3KR12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
J3KR12 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
J3KR12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
J3KR12 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
J3KR12 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
J3KR12 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
J3KR12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KR12 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KR12 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KR12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KR12 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KR12 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KR12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KR12 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
J3KR12 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
J3KR12 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
J3KR12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
J3KR12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
J3KR12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
J3KR12 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
J3KR12 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
J3KR12 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms