Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC188H7C350 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC188H7C350 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC188H7C350 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms