Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PQ18 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PQ18 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PQ18 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PQ18 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PQ18 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E9PQ18 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PQ18 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PQ18 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PQ18 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PQ18 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PQ18 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PQ18 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E9PQ18 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
E9PQ18 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PQ18 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PQ18 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PQ18 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PQ18 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E9PQ18 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PQ18 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PQ18 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PQ18 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PQ18 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PQ18 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PQ18 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PQ18 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E9PQ18 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PQ18 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PQ18 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PQ18 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PQ18 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PQ18 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PQ18 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PQ18 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E9PQ18 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PQ18 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PQ18 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PQ18 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PQ18 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
E9PQ18 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PQ18 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PQ18 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PQ18 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PQ18 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PQ18 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E9PQ18 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PQ18 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PQ18 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PQ18 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PQ18 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PQ18 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PQ18 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E9PQ18 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PQ18 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PQ18 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
E9PQ18 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PQ18 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PQ18 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PQ18 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E9PQ18 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E9PQ18 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PQ18 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PQ18 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PQ18 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PQ18 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E9PQ18 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PQ18 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PQ18 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PQ18 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PQ18 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PQ18 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PQ18 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E9PQ18 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PQ18 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PQ18 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PQ18 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PQ18 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PQ18 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PQ18 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PQ18 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PQ18 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E9PQ18 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PQ18 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PQ18 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PQ18 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PQ18 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E9PQ18 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms