Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
WIPF3A6NGB9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WIPF3A6NGB9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WIPF3A6NGB9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
WIPF3A6NGB9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1461.5 ms