Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA6L4A6NEF3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L4A6NEF3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms