Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS37CA5D8V6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS37CA5D8V6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
VPS37CA5D8V6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms