Protein–RNA interactions for Protein: A2A3L6

TTC24, Tetratricopeptide repeat protein 24, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC24A2A3L6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC24A2A3L6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC24A2A3L6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TTC24A2A3L6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TTC24A2A3L6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms