Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRGMA1A4Y4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRGMA1A4Y4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IRGMA1A4Y4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms