Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A087WXM4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A087WXM4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A087WXM4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A087WXM4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms