Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUV0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUV0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A087WUV0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A087WUV0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A0A087WUV0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms