Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEC24CP53992 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms