Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PMF1-BGLAPU3KQ54 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PMF1-BGLAPU3KQ54 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PMF1-BGLAPU3KQ54 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms