Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC6Q9Y625 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC6Q9Y625 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms